Xã Ninh Xuân cách trung tâm thành phố Ninh Bình là 4,5 km, có vị trí địa lý:

• Phía đông giáp thành phố Ninh Bình
• Phía nam giáp xã Ninh Thắng và Ninh Hải
• Phía tây giáp xã Ninh Hải
• Phía bắc giáp xã Trường Yên và Ninh Hoà.

Xã Ninh Xuân có diện tích là 9,75 km², dân số năm 2019 là 4.167 người[1], mật độ dân số đạt 427 người/km².

Quần thể danh thắng Tràng An có trung tâm đón tiếp và một phần diện tích nằm trên xã này.